MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chromosome

Total Repeats: 34405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007205	CTAT	2	8	529	536	25 %	50 %	0 %	25 %	304570536
2	NC_007205	T	6	6	540	545	0 %	100 %	0 %	0 %	304570536
3	NC_007205	CAT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304570536
4	NC_007205	GAT	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304570536
5	NC_007205	CTTC	2	8	704	711	0 %	50 %	0 %	50 %	304570536
6	NC_007205	TTCTT	2	10	713	722	0 %	80 %	0 %	20 %	304570536
7	NC_007205	CAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570536
8	NC_007205	ATAC	2	8	752	759	50 %	25 %	0 %	25 %	304570536
9	NC_007205	CTG	2	6	770	775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304570536
10	NC_007205	CTA	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304570536
11	NC_007205	TAA	2	6	914	919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304570536
12	NC_007205	CCA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570536
13	NC_007205	AAAT	2	8	957	964	75 %	25 %	0 %	0 %	304570536
14	NC_007205	AAT	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304570536
15	NC_007205	C	6	6	1011	1016	0 %	0 %	0 %	100 %	304570536
16	NC_007205	TGA	2	6	1072	1077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304570536
17	NC_007205	CCA	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570536
18	NC_007205	ATCA	2	8	1182	1189	50 %	25 %	0 %	25 %	304570536
19	NC_007205	TCA	2	6	1285	1290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304570536
20	NC_007205	CAG	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570536
21	NC_007205	ACA	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570536
22	NC_007205	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304570536
23	NC_007205	GTGCAT	2	12	1439	1450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304570536
24	NC_007205	T	7	7	1481	1487	0 %	100 %	0 %	0 %	304570536
25	NC_007205	TTAA	2	8	1492	1499	50 %	50 %	0 %	0 %	304570536
26	NC_007205	CATTTT	2	12	1527	1538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304570536
27	NC_007205	T	8	8	1535	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	304570536
28	NC_007205	TAAT	2	8	1553	1560	50 %	50 %	0 %	0 %	71082711
29	NC_007205	CTAT	2	8	1647	1654	25 %	50 %	0 %	25 %	71082711
30	NC_007205	TCT	2	6	1658	1663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082711
31	NC_007205	CAG	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71082711
32	NC_007205	ATTT	2	8	1690	1697	25 %	75 %	0 %	0 %	71082711
33	NC_007205	CAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082711
34	NC_007205	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	71082711
35	NC_007205	TCT	2	6	1812	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082711
36	NC_007205	AAC	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082711
37	NC_007205	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	71082711
38	NC_007205	TGT	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71082711
39	NC_007205	T	8	8	1926	1933	0 %	100 %	0 %	0 %	71082711
40	NC_007205	ACA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082711
41	NC_007205	TG	3	6	2044	2049	0 %	50 %	50 %	0 %	71082711
42	NC_007205	CTTTTC	2	12	2116	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082712
43	NC_007205	TC	3	6	2212	2217	0 %	50 %	0 %	50 %	71082712
44	NC_007205	T	6	6	2275	2280	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
45	NC_007205	AAT	2	6	2377	2382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082712
46	NC_007205	T	7	7	2382	2388	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
47	NC_007205	GTA	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082712
48	NC_007205	AT	3	6	2424	2429	50 %	50 %	0 %	0 %	71082712
49	NC_007205	AAAT	2	8	2440	2447	75 %	25 %	0 %	0 %	71082712
50	NC_007205	CTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71082712
51	NC_007205	T	7	7	2537	2543	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
52	NC_007205	GCT	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71082712
53	NC_007205	CATC	2	8	2612	2619	25 %	25 %	0 %	50 %	71082712
54	NC_007205	TGCTG	2	10	2643	2652	0 %	40 %	40 %	20 %	71082712
55	NC_007205	T	6	6	2700	2705	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
56	NC_007205	TAA	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082712
57	NC_007205	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71082712
58	NC_007205	T	6	6	2821	2826	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
59	NC_007205	TTA	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082712
60	NC_007205	T	6	6	2852	2857	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
61	NC_007205	T	6	6	2859	2864	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
62	NC_007205	ATTG	2	8	2936	2943	25 %	50 %	25 %	0 %	71082712
63	NC_007205	GGAT	2	8	2945	2952	25 %	25 %	50 %	0 %	71082712
64	NC_007205	T	6	6	2970	2975	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
65	NC_007205	GA	3	6	2983	2988	50 %	0 %	50 %	0 %	71082712
66	NC_007205	ATC	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082712
67	NC_007205	ATTA	2	8	3035	3042	50 %	50 %	0 %	0 %	71082712
68	NC_007205	TGCAT	2	10	3057	3066	20 %	40 %	20 %	20 %	71082712
69	NC_007205	GCTT	2	8	3200	3207	0 %	50 %	25 %	25 %	71082712
70	NC_007205	CCA	3	9	3228	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71082712
71	NC_007205	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
72	NC_007205	T	7	7	3291	3297	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
73	NC_007205	AAC	2	6	3323	3328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082712
74	NC_007205	T	6	6	3329	3334	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
75	NC_007205	CTGGTC	2	12	3400	3411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71082712
76	NC_007205	TGT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71082712
77	NC_007205	TAAC	2	8	3472	3479	50 %	25 %	0 %	25 %	71082712
78	NC_007205	GTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082712
79	NC_007205	GT	3	6	3551	3556	0 %	50 %	50 %	0 %	71082712
80	NC_007205	TTG	2	6	3628	3633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71082712
81	NC_007205	ACA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082712
82	NC_007205	GCA	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71082712
83	NC_007205	CTAA	2	8	3723	3730	50 %	25 %	0 %	25 %	71082712
84	NC_007205	GAT	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082712
85	NC_007205	T	6	6	3753	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	71082712
86	NC_007205	TCA	2	6	3762	3767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082712
87	NC_007205	GAA	2	6	3775	3780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71082712
88	NC_007205	AGA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71082713
89	NC_007205	T	7	7	3921	3927	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
90	NC_007205	T	7	7	3930	3936	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
91	NC_007205	TCA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082713
92	NC_007205	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
93	NC_007205	T	6	6	4152	4157	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
94	NC_007205	ATT	2	6	4176	4181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082713
95	NC_007205	T	6	6	4208	4213	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
96	NC_007205	CAA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082713
97	NC_007205	CATA	2	8	4298	4305	50 %	25 %	0 %	25 %	71082713
98	NC_007205	AT	3	6	4307	4312	50 %	50 %	0 %	0 %	71082713
99	NC_007205	T	6	6	4404	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
100	NC_007205	T	8	8	4416	4423	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
101	NC_007205	CTT	2	6	4427	4432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082713
102	NC_007205	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
103	NC_007205	CCA	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71082713
104	NC_007205	T	7	7	4547	4553	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
105	NC_007205	T	7	7	4555	4561	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
106	NC_007205	T	7	7	4574	4580	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
107	NC_007205	CAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082713
108	NC_007205	ATG	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082713
109	NC_007205	T	7	7	4657	4663	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
110	NC_007205	CTTG	2	8	4667	4674	0 %	50 %	25 %	25 %	71082713
111	NC_007205	T	6	6	4701	4706	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
112	NC_007205	TGA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082713
113	NC_007205	T	8	8	4748	4755	0 %	100 %	0 %	0 %	71082713
114	NC_007205	ATT	2	6	4831	4836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082713
115	NC_007205	AT	3	6	4854	4859	50 %	50 %	0 %	0 %	71082714
116	NC_007205	CTT	2	6	4860	4865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082714
117	NC_007205	ATT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082714
118	NC_007205	T	6	6	4900	4905	0 %	100 %	0 %	0 %	71082714
119	NC_007205	TAG	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082714
120	NC_007205	ATTTT	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	71082714
121	NC_007205	T	7	7	4960	4966	0 %	100 %	0 %	0 %	71082714
122	NC_007205	CAA	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082714
123	NC_007205	T	6	6	5019	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	71082714
124	NC_007205	TGT	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71082714
125	NC_007205	TCA	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082714
126	NC_007205	ATT	2	6	5106	5111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082714
127	NC_007205	TCT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082714
128	NC_007205	T	8	8	5159	5166	0 %	100 %	0 %	0 %	71082714
129	NC_007205	T	8	8	5209	5216	0 %	100 %	0 %	0 %	71082714
130	NC_007205	TC	3	6	5221	5226	0 %	50 %	0 %	50 %	71082714
131	NC_007205	CAA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082714
132	NC_007205	TTA	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082714
133	NC_007205	CTC	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71082714
134	NC_007205	TTC	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082714
135	NC_007205	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082714
136	NC_007205	TCC	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71082714
137	NC_007205	CTTG	2	8	5781	5788	0 %	50 %	25 %	25 %	71082714
138	NC_007205	CAA	2	6	5872	5877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082714
139	NC_007205	TCT	2	6	5922	5927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082714
140	NC_007205	CT	3	6	5967	5972	0 %	50 %	0 %	50 %	71082714
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273	NC_007205	A	7	7	11469	11475	100 %	0 %	0 %	0 %	71082721
274	NC_007205	ATT	2	6	11494	11499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082721
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